大山沢に行ってきた

今日は，モニ1000のリタートラップの回収と継続調査のために大山沢に行ってきた!!

このところの梅雨の影響で，大山沢までの林道はあちこちでかなり崩れていた。

大若沢（学習の森）の先を過ぎたところには，林道の真ん中に直径1mの岩が...
でも大山沢までの道のりはまだ長く，ここから歩いていく気力もない。
かろうじて車一台が通り抜けることができるぐらいのスペースがあったので，道の真ん中にお座りになられている岩様の脇をすり抜けることに。

うまくいっただろ！！と思った瞬間。

「グニッ」

と鈍い音が...

よく見ると，車の下の方に少し傷が...
あぁ，悲し...

でも上からこんなモノ（岩）が落ちてくると思うと怖いですね〜

その後の調査は何事もなく終わりました。

2010年7月11日　埼玉県中津川

帰りには，先程の岩様もいなくなっていたので，路肩の花を楽しみながら，無事に下山することができました!!

イワギボウシ Hosta longipes (Franch. et Sav.) Matsum. 

2010年7月11日　埼玉県中津川

キリンソウ　Phedimus aizoon (L.) ’t Hart var. floribundus (Nakai) H.Ohba

2010年7月11日　埼玉県中津川

Hierarchical Partitioning

Hierarchical Partitioningについて

温暖化関係の2000年代前半の論文をあさっていると，よくこの言葉を目にします。
多重共線性に対処するための手法らしいのですが，気になって調べてみると

MacNally (1996) Hierarchical partitioning as an interpretative tool in multivariate inference, Austral Ecology 21, 224-228

MacNally (2000) Regression and model-building in conservation biology, biogeography and ecology: The distinction between – and reconciliation of – ‘predictive’ and ‘explanatory’ models, Biodiversity and Conservation, 9, 655-671

MacNally (2004) Multiple regression and inference in ecology and conservation biology: further comments on identifying important predictor variables, Biodiversity and Conservation,11, 1397-1401

どうも，何かに似ているな〜


MacNally & Walsh (2004) Hierarchical partitioning public-domain software, Biodiversity and Conservation 13, 659-660

S・Rでもパッケージがあるみたいだな〜
と，いろいろ探していると...

Gibson et al. (2004) Spatial prediction of rufous bristlebird habitat in a coastal heathland: a GIS-based approach, Journla of Ecology, 41, 213-223

やっぱり，Akaike weightでした

丹沢へ行ってきた

今日はマスターの調査の手伝いのために丹沢へ!!

そう手伝い...
手伝い...
つまり，運転手ですね...

ということで，久しぶりの丹沢です

今日の調査内容は，山の中を歩き回って植物の葉っぱを採取すること!!
なにやらマスターの彼は，植物体の分析のお仕事をするみたい

でも，彼はあまり植物は詳しくないので（もっとも私もそんなに詳しくはないけれど...），
山の中を歩き回ってお目当ての樹木を探すお手伝いです

昼過ぎからガスが出てきましたが，調査自体は非常に快適に終わりました!!

んで，山を下りてきてふと足下をみると..............!!

コケイラン　Oreorchis patens (Lindl.) Lindl.

2010年6月15日　丹沢

コケイラン　Oreorchis patens (Lindl.) Lindl.

2010年6月15日　丹沢

コケイラン　Oreorchis patens (Lindl.) Lindl.

2010年6月15日　丹沢

そうコケイランOreorchis patens (Lindl.) Lindl


初めてお目にかかりました♪
今日はいい一日でした!!

GRASS GIS用GISDBファイル一式

日本で使われている主な投影法のGRASS GIS用GISDBファイルを作成しました。

GRASS GIS用GISDBファイル

ご入用の方はご自由にお使いください。ただし使用は自己責任でお願いします。

座標系

• UTM zone 51～56
• 緯度経度
• 平面直角座標系

測地系

• 世界測地系（JGD2000）
• WGS８４
• 日本測地系（Tokyo）

注意事項

• 必要なGISDBをコピーしてお使いください。
• 解像度は各自で設定してください。
• 使用する前に投影法が正しく設定されているが確認してください。
• 間違いを見つけた方は比嘉 mhiga@air.ocn.ne.jp まで連絡をお願いします。平面直角座標系についてはあまり使わないので自身がありません。

以下リスト（フォルダ名：座標系-測地系）

• JPRCS1-JGD2000
• JPRCS1-tokyo
• JPRCS10-JGD2000
• JPRCS10-tokyo
• JPRCS11-JGD2000
• JPRCS11-tokyo
• JPRCS12-JGD2000
• JPRCS12-tokyo
• JPRCS13-JGD2000
• JPRCS13-tokyo
• JPRCS14-JGD2000
• JPRCS14-tokyo
• JPRCS15-JGD2000
• JPRCS15-tokyo
• JPRCS16-JGD2000
• JPRCS16-tokyo
• JPRCS17-JGD2000
• JPRCS17-tokyo
• JPRCS18-JGD2000
• JPRCS18-tokyo
• JPRCS19-JGD2000
• JPRCS19-tokyo
• JPRCS2-JGD2000
• JPRCS2-tokyo
• JPRCS3-JGD2000
• JPRCS3-tokyo
• JPRCS4-JGD2000
• JPRCS4-tokyo
• JPRCS5-JGD2000
• JPRCS5-tokyo
• JPRCS6-JGD2000
• JPRCS6-tokyo
• JPRCS7-JGD2000
• JPRCS7-tokyo
• JPRCS8-JGD2000
• JPRCS8-tokyo
• JPRCS9-JGD2000
• JPRCS9-tokyo
• UTM51-JGD2000
• UTM51-tokyo
• UTM51-wgs84
• UTM52-JGD2000
• UTM52-tokyo
• UTM52-wgs84
• UTM53-JGD2000
• UTM53-tokyo
• UTM53-wgs84
• UTM54-JGD2000
• UTM54-tokyo
• UTM54-wgs84
• UTM55-JGD2000
• UTM55-tokyo
• UTM55-wgs84
• UTM56-JGD2000
• UTM56-tokyo
• UTM56-wgs84
• latlon-JGD2000
• latlon-tokyo
• latlon-wgs84

※JPRCS： Japan Plane Rectangular Coordinate System

グラフィックディバイス

今までまったく知らなかったけど、RはSVG形式でもグラフを出力できる!!

パッケージ 'grDevices' の情報

これまではわざわざPDFに出力してInkscapeで編集、

またはEPSに出力してpstoeditでSVG形式に変換してからInkscapeで編集していた。

　pstoedit -f plot-svg *.eps *.svg 

けど、これからはInkscape標準のSVG形式で出力すことにしよう!!

> dev.print(svg,file="filename.svg")

> dev.off()

ubuntu10.04 LTS (Lucid Lynx)

本日、ubuntuの新しいバージョンがリリースされました。

ubuntu10.04 LTS (Lucid Lynx)

これまで8.10を使っていたけど、約1年半ぶりにアップグレードすることに

８.10でも使用には特に問題なかったけど、GRASSやQGISの新しいバージョンを試してみたくなったのと、システムを整理したかった（最近 "|"が入力できなくなっていたので...）ので！！

インストールはこれまでよりも簡単で、思ったよりも短時間で終了！！

まだ不安定なところはあると思うけど、様子を見ながら使っていきましょうかね〜♪

報告書

これまで1ヵ月間かかりきりだった、とある研究助成の報告書が完成しました！！

長かったな...
というか直前までまったく処理していなかったことに反省...

でもおかけでいいデータをとることができました♪

さっそく、論文にするとしましょうかね！！