ubuntuでrgdal

ubuntu上のRでspgrass６を使うときの防備録

通常ではrgdalのインストール中にエラーがでる。
こちらのサイトを参考に、以下のパッケージをインストール

sudo aptitude install gdal libgdal-dev libproj-dev

Netcdfではまる

心を入れ替えてしばらく温暖化の仕事も励むことに...

んで、温暖化の気候データの整備をすることになった..

とりあえずCMIP3から将来の気候変化シナリをダウンロードしてきて、見様見真似でFortranに読み込もうと思ったらかなりはまった...

ここやここをを参考にコードを書いてコンパイルしようとしたらエラー...エラー...era-

$ f95 netcdf.f90
/tmp/ccG3fNB4.o: In function `MAIN__':
netcdf.f90:(.text+0x93): undefined reference to `nf_open_'
netcdf.f90:(.text+0xcf): undefined reference to `nf_inq_varid_'
netcdf.f90:(.text+0x107): undefined reference to `nf_get_var_real_'
netcdf.f90:(.text+0x133): undefined reference to `nf_close_'
collect2: ld returned 1 exit status

Netcdfのライブラリがうまく読み込めていないらしい...

いろいろとネットを徘徊していると、ライブラリの場所を指定してやれば良いとのこと

$ f95 -L/usr/include -lnetcdf netcdf.f90
/tmp/cclfbtkk.o: In function `MAIN__':
netcdf.f90:(.text+0x93): undefined reference to `nf_open_'
netcdf.f90:(.text+0xcf): undefined reference to `nf_inq_varid_'
netcdf.f90:(.text+0x107): undefined reference to `nf_get_var_real_'
netcdf.f90:(.text+0x133): undefined reference to `nf_close_'
netcdf.f90:(.text+0x1b6): undefined reference to `nf_strerror_'
collect2: ld returned 1 exit status

が、それでもエラーがでる。
またネットの徘徊を続けていると、ライブラリの指定が足りないみたい

hoge@Lynx:/media/hoge$ f95 -L/usr/include -lnetcdf -L/usr/lib/ -lnetcdff netcdf.f90

なんとかコンパイルはできるようになった。










...がまだ読み込めない...



いや〜先は長そうだ...

投稿

先日リジェクトされた論文を今日再投稿しました!!

プロジェクトのお仕事なので、通ってくれないと困るのですが...
まあ、しょぼい論文を書いている自分が悪いってはなしですが...

エディター、レビューアの皆様よろしくお願いします!!

最近のお仕事

当初の自分の予定を過ぎてしまいましたが、学振で一時中断していた論文が今日書きあがりました!!
今回は割と素直に書き上げることができたように思う。

おそらく自分の専門ではないからかな〜!?

コメントを待ってしばらく熟成させた後、7月末までには投稿したいですね〜

さて、これからしばらくは7月末締切りの論文にとりかからねば...
もちろんプロジェクトのお仕事もしなくちゃいけませんが....

QGISアップデート

QGISがアップデートされましたね!!
最新バージョンは1.7.0-Wroclawだそうです。

今日の朝、ubuntuのアップデートマネージャーが起動して、自動的にアップデートされました。
ちなみに、公式サイトではまだ1.6のままでした。Windowsユーザーはもうしばらく待ちでしょうか。

起動時のフラッシュでは、人文字でQが描かれています。

ヘルプのアバウトから変更点を確認することができます。

最近QGISを使うこともほとんどなくなったのですが、ちょっとファイルを確認したいときにはやっぱり便利ですね。

もう少し全体の安定性が改善されるといいのですが!!
今後に期待です。

我苦心

世の若手研究者の年間行事のひとつの学振!!

5月の中旬からやく3週間、いろいろな人に迷惑をかけつつ、ない知恵をしぼりつつ、ようやく申請書を書き上げました。

今回は少し方向転換して、新たな研究分野・計画の申請。
ほとんど専門外なので、かなり苦心したけど、勉強になりました。

通る見込みはないけれど、たまに自分の研究をまとめるといろいろなことがブラッシュアップされますね〜！！


さて、論文執筆に戻るとしますか。

リジェクト

またリジェクトされました...
プロジェクトのお仕事なのですが、最初の一歩がなかなか踏み出せません...

この前は、約３ヶ月待ってレビューアリジェクトでしたが、今回は３週間ちょっとでエディターリジェクトです。
リジェクトの理由（↓）も至ってシンプルです。

it does not fully fit the scope

さて、次を探しますか...